今新疆、内蒙古、青海甘肃的一部分在明朝的部分间内处它的疆域外。在些区建立的政权主有：
14世纪40年代，察合台汗国陷分裂，至60年代西察合台汗国演变帖木儿汗国。1370年(明洪武三年)东察合台汗居别失八，1418年(永乐十六年)西迁亦力(一亦力巴力，今新疆伊宁市)，明朝史籍即城名称其国名。辖境包括今新疆除哈密区额尔齐斯河、乌伦古河东北区外，境外巴尔喀什湖、塔什干东帕米尔高原。16世纪期，山北区的东部已瓦剌所占，其余分裂几部：吉利吉斯，在今巴尔喀什湖东南一带：哈萨克，在今伊犁河流域；叶尔羌，在今塔木河流域帕米尔高原；土鲁番，在今山南东部区甘肃西部。
鞑靼始见唐代中叶，是突厥统治的部族，兴的蒙古是其中一支。元亡，明朝又将蒙古高原东部蒙古吉思汗裔各部称鞑靼。
瓦剌，清称卫拉特、额鲁特、厄鲁特，本在叶尼塞河游，被吉思汗征服蒙古一部。明朝泛指蒙古高原西部阿尔泰山一带的部族。
1368年(明洪武元年)元帝退，北迁。次年明军攻，元帝再次北逃。二年明军又攻克应昌(今内蒙古克什克……（内容加载失败！）
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