噶尔丹并有强迫伊斯兰教徒改变己的信仰，他需的是一服从己己提供军需物资的稳定领。他扶持伊斯玛依勒汗的侄子阿卜杜·什特傀儡汗，同封伊达耶提拉“阿巴克”，就是“首领”，但伊达耶提拉却蒙语“阿巴克”改了波斯语“阿帕克”，就了“宇宙”的意思。从此，阿帕克卓便了山南麓的实际统治者，每年向准噶尔汗国缴纳十万两白银24万斤麦子的贡赋。
阿帕克卓横征暴敛的统治了十年，其间更换了两汗，在他死不八月，儿子雅雅卓便被杀。白山派的统治结束，卓族被准噶尔人囚禁伊犁。他的死头黑山派在准噶尔人扶持掌握权。
17世纪末，再有傀儡叶尔羌汗现，汗国的尾声结束了。
1755年，清朝乾隆皇帝派遣军攻伐准噶尔末代汗王达瓦奇，准噶尔汗国崩溃。白山派卓波罗尼、霍集占兄弟趁机摆囚禁，归附清朝。
在清朝的支持，波罗尼攻占叶尔羌等，黑山派卓加罕及其属全部被杀，仅有其弟弟阿卜杜拉两儿子逃亡。
但清朝是不再允许独立的宗教政权现在山南的。波罗尼、霍集占兄弟是1757年公兵反清，史称“卓乱”。
1759年，兄弟二人最……（内容加载失败！）
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