骑在铁之扫帚上的魔女滑翔在夜空之中。这里是《塔京》。灵魂术士们（soulwizards）聚集的魔法之都。能够改造自己的灵魂，消耗死者的灵魂并制造出[奇迹]的人们便是灵魂术士。 时钟塔学园·双子宫所属的魔术师·黑乃一将作为[自由骑士]，与自己的守护灵布伦希尔德一同进行着《儿雷也》讨伐任务。 拥有动物灵专家这么个外号的一将通过妙计战胜了《儿雷也》。从燃烧殆尽的敌方基地中发现了拥有金发少女姿态的机械《索菲亚=04》。它给了一将幸运与不幸……